Fondée en 1959, la Faculté des Pêches, relevant de l’Institut d’Agriculture et de Sylviculture (devenue actuellement Université de l’Agriculture de Hanoï 1) est la prédécesseur de l’Université de Nha Trang. Le 16 août 1966, la Faculté des Pêches est séparée de l’Institut d’Agriculture et de Sylviculture pour devenir École de l’Aquaculture. EN 1977, elle a été transférée de Hai Phong à Nha Trang en adoptant le nom de l’Université de l’Aquaculture. Depuis 1980, elle se connaissait sous le nom de l’Université des Pêches. Le 25 juillet 2006, elle a changé encore une fois de nom en adoptant le titre de l’Université de Nha Trang.
L'appellation "Université des pêches" devient "Université de Nha Trang" (courriel de Trinh Hong Minh du BAP, via C.Versieux, 22 sept. 2006)
L'université de Nha Trang est devenue une prestigieuse institution multidisciplinaire et multi-niveaux avec une base solide de la pêche et de l'aquaculture.