Créée par le Gouvernement Béninois (décret n°2016-638 du 13 octobre 2016 portant création de quatre Universités nationales en République du Bénin), l’UNA a pour mission la formation des cadres professionnels, la recherche scientifique et l’appui au développement dans les domaines des sciences agronomiques, sociologiques, économiques, agropastorales, halieutiques, forestières, environnementales et domaines assimilés ou dans tout autre domaine qui entre dans son champ de compétences. Dans ses perspectives d’avenir, l’UNA se projette comme une « Université de développement durable à rayonnement international, autonome, qui génère des connaissances et des technologies appropriées et fournit des professionnels hommes et femmes compétents, qui entreprennent, innovent et valorisent les différents types de savoirs ». Sur le plan académique et de la formation à l’entreprenariat, l’UNA compte à ce jour neuf (9) écoles professionnelles qui proposent des offres de formation conduisant à la licence professionnelle et au master professionnel. Sur le plan académique et de la formation à la recherche, elle dispose d’une école doctorale, dénommée Ecole Doctorale des Sciences Agronomiques et de l’Eau (EDSAE).