L'Université française du Pacifique a été créée par Décret du 29 mai 1987.
Son Président est nommé par le Ministère de l'éducation nationale, de l'enseignement supérieur et de la recherche. Elle est administrée par un Conseil d'administration assisté d'un Conseil scientifique et culturel.
Elle comporte deux Centres, l'un à Nouméa (Nouvelle-Calédonie), l'autre à Papeete (Polynésie française). En Nouvelle-Calédonie, l'année académique débute en février et se termine en novembre, tandis qu'en Polynésie française, elle débute en septembre et se termine en juin.
L'Université comporte un service commun.
Au 7 janvier 1996, l'Université comptait 2 450 étudiants.