PRISA a succédé au programme PIRAT (Petites initiatives de recherche, d’animation et de transfert), qui visait à appuyer des projets de recherche ou de gouvernance et à encourager la structuration de la coopération scientifique Nord-Sud.
Depuis 2017, PRISA est le principal mécanisme de l’AUF pour soutenir des collaborations entre ses membres des Amériques en matière de recherche. Les projets PRISA admettent l’ensemble des disciplines universitaires et associent au moins deux établissements des Amériques, dont au moins un membre situé en Amérique latine. Des membres d’autres régions du monde peuvent s’y joindre.